答案：3只。

假如只有1只动物，那么该家禽的主人在第一天看到其余49只鸡都没病时，就知道自己家的有病了，故第一天就会有枪声。假如有2只生病的话，其主人分别为甲和乙，第一天没有枪声响起，在第二天甲会做如下思考：如果我的家禽没病，那么乙在昨天看到的49只家禽全都是正常狗，他就会知道自己的家禽有病从而开枪了。他为什么没开枪？这说明他看到我的家禽有病。于是甲会在第二天开枪。当然同理，乙也会在第二天开枪。实际情形是，第三天才出现枪声，那么按照上述方法推理：一定有3只病鸡。